Mayra Furlan Magaril

Intereses de Investigación

Organización 3-dimensional y regulación epigenética del genoma

El interés de mi laboratorio se centra en el estudio de los diversos procesos epigenéticos que regulan la expresión genética y en particular, el papel que juega la organización tridimensional del genoma al interior del espacio nuclear en dicho proceso.

Nos interesa entender que tan dinámicas son las estructuras genómicas en 3D, desde los dominios, hasta las asas de cromatina entre genes y elementos de regulación, durante procesos en donde existen cambios drásticos en los niveles de transcripción de genes en células diferenciadas.
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3D genome organization and epigenetic regulation

The interest of my laboratory is centered in the epigenetic processes that regulate gene expression, particularly in how genome spatial organization within the nucleus is linked to a given transcriptional state.

From large topological domains to local chromatin loops connecting genes with their regulatory elements, we aim to understand how dynamic these 3D structures are using models in which drastic transcriptional changes take place in mature cells.

Trayectoria Profesional

Investigadora Titular A

Posdoctorados y Estancias

Nuclear Dynamics Program, Babraham Institute, Cambridge, United Kingdom, (2011-2015)

Formación Académica

Bióloga, Facultad de Ciencias, Ciudad Universitaria, UNAM, Ciudad de México ()

Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM, Instituto de Fisiología Celular, México ()

Ligas de Interés

Google scholar
Plática en el Insituto de Ciencias Nucleares en el marco del encuentro Ciencia-Ficción-Ciencia: Del DNA basura a la esencia de la complejidad animal

Líneas de Investigación

Alumnos Graduados: Ayerim Esquivel López- LICENCIATURA Aura Stephenson Gussinye- MAESTRÍA Andrés Penagos Puig- MAESTRÍA Sherlyn Claudio Galeana - MAESTRÍA Amaury Aguilar Lomas - MAESTRÍA Ayerim Esquivel López - MAESTRÍA Luis Tenorio Hernández - MAESTRÍA

Cambios en la organización tridimensional del genoma, la accesibilidad cromatínica y la expresión genética durante la maduración eritroide: Los eritrocitos son células altamente especializadas que transportan el oxígeno por el torrente sanguíneo. Durante la maduración eritroide existe un silenciamiento transcripcional global de la expresión génica aunado a la condensación de la estructura de la cromatina y la reducción del tamaño nuclear y celular. Dicho paisaje representa un escenario de características únicas que nos permite estudiar los mecanismos epigenéticos involucrados en un proceso de silenciamiento genómico así como los cambios asociados a nivel de la topología del genoma al interior del espacio nuclear._______Red Blood Cells (RBC) are highly specialized cells that transport oxygen through the blood stream to reach all tissues in the body. During erythroid maturation there is a global gene expression silencing and RNA production, chromatin is compacted and there is a reduction in nuclear and cellular size. Such landscape represents a unique scenario to study the epigenetic and structural mechanisms involved during this genome wide silencing event.

Estudio de la estructura de la cromatina en tumores de cáncer de mama y cáncer gástrico: Estamos caracterizando los cambios estructurales a nivel de topología y variaciones estructurales que ocurren en tumores de cáncer de mama y cáncer gástrico en pacientes mexicanas. Asi mismo los perfiles topológicos serán complementados con perfiles transcripcionales de células individuales.____ We are currently characterizing the structural changes that occur in breast cancer tumors and gastric cancer tumors from mexican patients. We will complement the topological changes with single cell transcriptomics.

Organización topológica y elementos de regulación remota de genes circadianos : Los genes circadianos presentan oscilaciones transcripcionales robustas con un pico máximo durante las 24 horas de día. Estos cambios transcripcionales se llevan acabo en un contexto celular constante (la identidad celular no cambia) y mayoritariamente postmitótica (las células no se dividen). Este escenario representa un modelo ideal para estudiar si la topología de los genes circádicos dentro del núcleo es dinámica en vinculo con su dinámica transcripcional. Asimismo, se desconoce si la regulación de genes circádicos está influenciada por elementos de regulación remotos como son los enhancers. En el laboratorio estamos contruyendo mapas de las interacciones genómicas por medio de HiC y Capture-HiC en alta resolución durante el día para estudiar la dinámica circádica del genoma, desde los territorios cromosomales hasta las asas que conectan genes y enhancers._______Circadian genes present robust oscilations in their transcription with a maximum expression peak once every 24 hours.These synchronized transcriptional changes occur in an otherwise constant cellular environment (post-mitotic cells without changes in their cell identity) which provides a great scenario to measure chromatin dynamics linked only to transcription. Also, little is known about the role of remote regulatory elements controlling circadian gene expression.

Integrantes del Laboratorio

Rosario Pérez Molina

Estudiantes